Tres expertos españoles en secuenciación y vigilancia genómica del nuevo coronavirus responden a nuestras preguntas sobre la nueva variante detectada en Sudáfrica, en declaraciones al portal internacional de información confiable Covid-19 Vaccine Media Hub, en el que SINC es el nodo español. Coinciden en señalar que es importante vigilar su evolución, pero sin alarmar a la población.

Iñaki Comas

Codirector del consorcio SeqCovid-España, investigador del Instituto de Biomedicina de Valencia (IBV) CSIC

De momento, poco. Por un lado, acumula una gran cantidad de mutaciones en el pico, incluidas algunas que creemos están asociadas a una mayor transmisibilidad y otras asociadas a una reducción de la eficacia de los anticuerpos. Sin embargo, al no vernos nunca juntos, no podemos saber si este es realmente el caso o no. Para ello ya se están realizando experimentos que nos permiten decir si la respuesta a los anticuerpos es similar o no, y en paralelo miramos su tasa de crecimiento epidemiológico, lo que nos permitirá saber si tiene una mayor o menor transmisibilidad que delta.

El rápido crecimiento en Sudáfrica, desplazando a Delta, no necesariamente indica una ventaja de transmisibilidad

El hecho de que Sudáfrica haya experimentado un rápido crecimiento hasta ahora, desplazando a Delta, no indica necesariamente una ventaja en la transmisibilidad. Hay que esperar a ver qué rumbo sigue en Sudáfrica y, sobre todo, a comparar con otros países, a ver si hay una brecha o no. Por ejemplo, la versión beta era una que nos preocupaba mucho en ese momento, pero nunca despegó más allá de Sudáfrica. Por tanto, es necesario ver qué trayectoria sigue en países con diferentes situaciones epidemiológicas (vacunación, casos crecientes o decrecientes, etc.). Sí es cierto que en Sudáfrica se está utilizando una prueba de identificación rápida (la secuenciación genómica lleva un tiempo) y sí parece que está creciendo a gran velocidad en las regiones donde se encuentra.

María Iglesias-Caballero

Investigador del Laboratorio de Referencia para la Gripe y los Virus Respiratorios del Centro Nacional de Microbiología, Instituto de Salud Carlos III

La variante se ha detectado en Botswana este mes y adquiere especial relevancia debido a la gran cantidad de cambios que ha adquirido su espícula. Está relacionado con el aumento de casos en Sudáfrica, estimándose que el 90% de los casos detectados por PCR en la provincia de Gauteng pueden deberse a esta variante. Según lo publicado por Tulio de Oliveira, director del Centro de Respuesta e Innovación Epidémica de Durban, en menos de dos semanas se ha convertido en el linaje circulante dominante, desbancando a la variante delta mayoritaria hasta el momento en dicha provincia.

Fernando González Candelas

Catedrático de Genética. Codirector del consorcio SeqCovid-España. Investigador de FISABIO-Universitat de València

Es una variante vinculada a un brote en una zona donde había muy poca circulación del virus y una gran población no vacunada. Esta variante de inmediato parece estar creciendo de manera desproporcionada, sobre todo, porque al estar asociada a un brote, casi todos los casos que dan positivo están relacionados con él y su frecuencia relativa es inmediatamente muy alta. Eso aparentemente hace que su tasa de crecimiento sea espectacular.

Es una variante vinculada a un brote en una zona donde había muy poca circulación del virus y una gran población no vacunada.

Por otro lado, y esto no hay que olvidarlo, es cierto que tiene muchas más mutaciones que las variantes que hemos visto hasta ahora. Solo en la proteína S, en el pico, ya hay 32 mutaciones en comparación con el virus original de Wuhan. Muchas de estas mutaciones en la espícula también se han visto anteriormente en variantes de interés y variantes de interés, pero esta es la primera en la que, digámoslo así, reúne muchas, muchas de ellas en un solo genoma.

Lo que aún no está claro y llevará tiempo saberlo con datos fiables y fiables es si la acumulación de todas estas mutaciones realmente tiene el efecto de incrementar la transmisibilidad, el posible escape a la inmunidad vacunal o la de una infección previa, o si es más las personas virulentas e infectadas tienen peor evolución. No tenemos ningún dato sobre todo esto y todo lo que podemos hacer en este momento es especular al respecto.

Iñaki Comas

Sí, se lo merece. No tanto por lo que sabemos que hace, que es poco por el momento, sino por el potencial de la combinación de mutaciones que vemos. Hemos visto a muchos de ellos en otras variantes de interés. Por tanto, sin entrar en alarma, debemos seguirlo y ver si estamos en un escenario como el delta de hace unos meses o si se trata de una falsa alarma.

Lo importante es tener la capacidad mundial para identificar estas amenazas potenciales, rastrearlas y evaluarlas.

Lo importante es tener la capacidad mundial para identificar estas amenazas potenciales, rastrearlas y evaluarlas. La gran mayoría llega a nada, pero algunos, como delta, han desplazado a las variantes anteriores, dificultando un poco el control epidemiológico.

En cualquier caso, ahora más que nunca, recuerda que la prevención se basa en múltiples capas, todas imperfectas pero muy buenas juntas. La mejor capa que tenemos son las vacunas, pero con delta hemos visto que no detienen suficientemente la transmisión. Sin embargo, eso sucede cuando agregamos las máscaras, la distancia y la ventilación. Y esa lección es válida para cualquier variante pasada, presente y futura.

María Iglesias-Caballero

En mi opinión, es importante controlar la circulación de esta variante y caracterizar sus cambios. La caracterización fenotípica de este conjunto de cambios en la espícula es muy importante, ya que entre los numerosos cambios descritos se encuentran cambios que pueden mejorar la afinidad por el receptor, como los cambios N440K y S477N, cambios que pueden tener impacto en la actividad. de anticuerpos neutralizantes, como los cambios E484A, T478K y Q493K, y cambios que pueden afectar el procesamiento de la proteína y, en consecuencia, su transmisión, como los cambios N679K y P681H. Por tanto, el estudio fenotípico de esta combinación de cambios es muy relevante para conocer su impacto real.

Hasta que no se disponga de un mejor conjunto de datos, sería poco estricto hacer afirmaciones sobre la transmisión o protección de la vacuna.

Hasta que no tengamos un mejor conjunto de datos, tanto epidemiológicos como virológicos, sería poco riguroso hacer afirmaciones sobre la transmisión o protección de las vacunas, aunque para quienes trabajamos en sistemas de vigilancia, cada aparición de una nueva variante merece nuestro pleno. atención. y trabajo.

Fernando González Candelas

Merece atención, pero eso: atención. Tenemos que ver qué le pasa en más escenarios y si llega a otros países qué pasa. Para eso hay que mirar, pero una cosa es mirar y otra es alarmar. No parece que la situación requiera una alarma, sino una vigilancia similar a la que se estaba realizando anteriormente con el resto de variantes.

Las vacunas siguen siendo tan eficaces como lo son. Hemos visto que con el tiempo la efectividad de las vacunas disminuye, de ahí las dosis de refuerzo, y no se puede esperar que esta variante sea diferente. Por lo tanto, mire pero no se alarme.

Iñaki Comas

Aún no lo sabemos, hemos visto anteriormente algunas de las mutaciones más preocupantes en ese sentido en otras variantes pero también sabemos que es la combinación de todas las mutaciones, cómo se combinan en una variante concreta, lo que determina su comportamiento. Conocemos algunas mutaciones de esta variante que reducen la neutralización por anticuerpos porque las hemos visto antes, no es una buena noticia, pero la respuesta inmune es mucho más compleja que la mediada por anticuerpos, incluida la respuesta celular que todos tenemos pero es Rara vez se mide porque no lo es. Es fácil.

Lo que sí sabemos es que las variantes que portan algunas de las mutaciones redujeron la efectividad un poco, pero no mucho, y todavía hubo una buena protección contra la hospitalización y la muerte.

María Iglesias-Caballero

Los estudios serológicos son necesarios para mostrar el impacto de esta variante en personas vacunadas. En teoría, este conjunto de cambios tiene el potencial de afectar la protección conferida por las vacunas. Además, la infección por esta variante se ha descrito en algunos vacunados con un esquema completo por Pfizer, Janssen y Astra Zeneca. La realidad es que, de momento, la muestra estudiada es pequeña, por lo que no disponemos de información completa al respecto.

Los estudios serológicos son necesarios para mostrar el impacto de esta variante en personas vacunadas.

Fernando González Candelas

Con lo que sabemos, no tenemos evidencia de que pueda afectar. Sabemos que tiene algunas mutaciones que disminuyen la capacidad de neutralización de anticuerpos específicos, pero las vacunas no desencadenan la producción de un solo anticuerpo, sino de muchos anticuerpos (posiblemente decenas).

No parece que este virus tenga la capacidad de eludir simultáneamente todos los anticuerpos que se producen cuando se vacuna a una persona. Disminuir sí, pero no para que tengamos que pensar que habrá un aumento de la incidencia grave en personas infectadas por esta variante a pesar de estar vacunadas, lo que no quiere decir que no haya que vigilarlo, si se produce Por tanto, tomar las medidas necesarias de control, revacunación o formulación de nuevas vacunas para corregir esta indeseable desviación.

Fuente: SINC | Derechos: Creative Commons.